пептиды

ПЕПТИДЫ

природные или синтетич. соед., молекулы которых построены из остатков α-аминокислот, соединенных между собой пептидными (амидными) связями C(O) NH. Могут содержать в молекуле также неаминокислотную компоненту (напр., остаток углевода). По числу аминокислотных остатков, входящих в молекулы П., различают ди-пептиды, трипептиды, тетрапептиды и т. д. П., содержащие до 10 аминокислотных остатков, наз. олигопептидами, содержащие более 10 аминокислотных остатков полипепти-дами Прир полипептиды с мол. м. более 6 тыс. наз. белками

Историческая справка. Впервые П. были выделены из ферментативных гидролизатов белков. Термин "П." предложен Э. Фишером. Первый синтетический П. получил T. Курциус в 1881 Э. Фишер к 1905 разработал первый общий метод синтеза П. и синтезировал ряд олигопептидов разл. строения. Существ. вклад в развитие химии П. внесли ученики Э. Фишера Э. Абдергальден, Г. Лейке и M. Бергман. В 1932 M Бергман и Л. Зервас использовали в синтезе П. бензилоксикарбонильную группу (карбобензоксигруппу) для защиты α-аминогрупп аминокислот, что ознаменовало новый этап в развитии синтеза П. Полученные N-защищен-ные аминокислоты (N-карбобензоксиаминокислоты) широко использовали для получения различных П., которые успешно применяли для изучения ряда ключевых проблем химии и биохимии этих веществ, напр., для исследования субстратной специфичности протеолитич. ферментов. С применением N-карбобензоксиаминокислот были впервые синтезированы природные П. (глутатион, карнозин и др.). Важное достижение в этой области разработанный в нач. 50-х гг. P. Вога-ном и др. синтез П. методом смешанных ангидридов (подробно методы синтеза П. рассмотрены ниже). В 1953 В. Дю Виньо синтезировал первый пептидный гормон -окси-тоцин. На основе разработанной P. Меррифилдом в 1963 концепции твердофазного пептидного синтеза были созданы автоматич. синтезаторы П. Получили интенсивное развитие методы контролируемого ферментативного синтеза П. Использование новых методов позволило осуществить синтез гормона инсулина и др.

Успехи синтетич. химии П. были подготовлены достижениями в области разработки таких методов разделения, очистки и анализа П., как ионообменная хроматография, электрофорез на разл. носителях, гель-фильтрация, высокоэффективная жидкостная хроматография (ВЭЖХ), иммуно-хим. анализ и др. Получили большое развитие также методы анализа концевых групп и методы ступенчатого расщепления П. Были, в частности, созданы автоматич. аминокислотные анализаторы и автоматич. приборы для определения первичной структуры П.-т.наз. секвенаторы.

Номенклатура П. Аминокислотный остаток П., несущий своб. α-аминогруппу, наз. N-концевым, а несущий своб. α-карбоксильную группу — С-концевым. Название П. образуется из назв. входящих в его состав аминокислотных остатков, перечисляемых последовательно, начиная с N-концево-го. При этом используют тривиальные назв. аминокислот, в которых окончание "ин" заменяется на "ил"; исключение C-концевой остаток, назв. которого совпадает с назв. соответствующей аминокислоты. Все аминокислотные остатки, входящие в П., нумеруются, начиная с N-конца. Для записи первичной структуры П. (аминокислотной последовательности) широко используют трехбуквенные и однобуквенные обозначения аминокислотных остатков (напр., Ala Ser -Asp Phe -GIy аланил-серил-аспарагил-фенилаланил-гли-цин).

Классификация П. Все П. делятся на гомомерные и гетеро-мерные. Гомомерные П. при гидролизе образуют только аминокислоты, гетеромерные наряду с аминокислотами соед. др. классов. В зависимости от структуры неаминокислотной компоненты, гетеромерные П. делятся на глико-, липо-, нуклео-, фосфопептиды и др. Гомомерные и гетеромерные П. могут быть линейными и циклическими. Аминокислотные остатки в них м. б. соединены между собой только пептидными связями (гомодетные П.) или не только пептидными сложноэфирными, дисульфидными и др. (гете-родетные П.). Гетеродетные П. с встроенными в цепь гидроксиаминокислотами наз. пептолидами. П., содержащие в молекуле остатки только одной аминокислоты, наз. гомо-полиаминокислотами, а содержащие одинаковые повторяющиеся участки (из одной или неск. аминокислотных остатков) регулярными П. Особую группу гетеромерных гетеро-детных П. образуют депсипептиды.

Строение. Пептидная связь имеет свойства частично двойной связи. Это проявляется в уменьшении длины этой связи (0,132 нм)по сравнению с длиной простой связи C N (0,147 нм). Частично двоесвязный характер пептидной связи делает невозможным своб. вращение заместителей вокруг нее. поэтому пептидная группировка является плоской и имеет обычно транс-конфигурацию (формула I). Таким образом, остов пептидной цепи представляет собой ряд жестких плоскостей с подвижным ("шарнирным") сочленением в месте, где расположены асимметрич. атомы С (в формуле I обозначены звездочкой).

пептиды

В растворах П. наблюдается предпочтительное образование определенных конформе-ров. С удлинением цепи более выраженную устойчивость приобретают (аналогично белкам) упорядоченные элементы вторичной структуры (α-спираль и β-структура). Образование вторичной структуры особенно характерно для регулярных П., в частности для полиаминокислот.

Свойства. Олигопептиды по свойствам близки к аминокислотам, полипептиды подобны белкам. Олигопептиды представляют собой, как правило, кристаллич. вещества, разлагающиеся при нагр. до 200 300 °C. Они хорошо раств. в воде, разб. кислотах и щелочах, почти не раств. в органических растворителях. Исключение Олигопептиды, построенные из остатков гидрофобных аминокислот.

Олигопептиды обладают амфотерными свойствами и, в зависимости от кислотности среды, могут существовать в форме катионов, анионов или цвиттер-ионов. Осн. полосы поглощения в ИК спектре для группы NH 3300 и 3080 см−1, для группы C=O 1660 см−1. В УФ спектре полоса поглощения пептидной группы находится в области 180–230 нм. Изоэлектрич. точка (рI) П. колеблется в широких пределах и зависит от состава аминокислотных остатков в молекуле. Величины рKа П. составляют для а-СООН ок. 3, для α-NH2 ок. 8.

Хим. свойства олигопептидов определяются содержащимися в них функц. группами, а также особенностями пептидной связи. Их хим. превращения в значит. мере аналогичны соответствующим реакциям аминокислот. Они дают положит. биуретовую реакцию и нингидриновую реакцию. Дипептиды и их производные (особенно эфиры) легко циклизуются, превращаясь в дикетопиперазины. Под действием 5,7 н.

соляной кислоты П. гидролизуются до аминокислот в течение 24ч при 105 °C.

Синтез. Хим. синтез П. заключается в создании пептидной связи между группой COOH одной аминокислоты и NH2 др. аминокислоты или пептида. В соответствии с этим различают карбоксильную и аминную компоненты реакции пептидного синтеза. Для проведения целенаправленного контролируемого синтеза П. необходима предварит. временная защита всех (или некоторых) функц. групп, которые не участвуют в образовании пептидной связи, а также предварит. активация одной из компонент пептидного синтеза. После окончания синтеза защитные группы удаляют. При получении биологически активных П. необходимое условие — предотвращение рацемизации аминокислот на всех этапах пептидного синтеза.

Все защитные группы делят на N-защитные (для временной защиты группы NH2), С-защитные (для временной защиты карбоксильных групп COOH) и R-защитные (для временной защиты др. функц. групп в боковой цепи аминокислот H2NCHRCOOH).

Среди N-защитных групп наиб. важными являются ацильные защитные группы [в т. ч. типа ROC(O)], а также алкильные и аралкильные защитные группы. Примеры N-защитных групп типа ROC(O)-бензилоксикарбонильная группа (карбобензоксигруппа) C6H5CH2OCO и трет-бутокси-карбонильная группа (CH3)3СОСО. К ацильным N-защит-ным группам относят: формильную HCO, трифторацетиль-ную CF3CO и др. Представители N-защитных групп алкиль-ной и аралкильной природы — триметилсилильная (CH3)3Si и трифенилметильная (тритильная) (C6H 5)3С.

Среди С-защитных групп важнейшими являются сложно-эфирные и замещенные гидразидные группы. К первым относят, напр., метокси-, этокси- и трет-бутоксигруп-пы. С-защитные группы гидразидного типа — бензилокси-карбонил-, трет-бутилоксикарбонил-, тритил- и фенил-гидразиды.

В качестве R-защитных групп широко используют ацильные группы, в т. ч. типа ROC(O) (для защиты аминогрупп и гуанидиногрупп в боковых цепях лизина и аргинина соотв.), сложноэфирные группировки (для защиты карбоксилов в боковых цепях аспарагиновой и глутаминовой кислот), а также алкильные и аралкильные группы (для защиты групп OH и SH в боковых цепях гидроксиаминокислот и цистеина соотв.).

Наряду с указанными группировками, для защиты амино-, гуанидино- и карбоксигрупп в молекулах исходных аминокислот или пептидов широко используют реакции соле-образования. Разработаны также спец. приемы временной защиты при синтезе П. тиоэфирной функции метионина, ими-дазольного кольца гистидина, амидных групп в боковых цепях аспарагина и глутамина, а также индольного кольца триптофана.

Наиб. важные способы образования пептидной связи при осуществлении реакции в растворе-методы активир. эфиров, кар-бодиимидный, смешанных ангидридов и азидный метод.

Метод активированных эфиров основан на предварит. образовании сложноэфирного производного карбоксильной компоненты путем введения в нее спиртового остатка, содержащего сильный электроноакцепторный заместитель. В результате образуется высокореакционноспо-собный эфир, легко подвергающийся аминолизу под действием аминокомпоненты пептидного синтеза. В качестве активир. эфиров при синтезе П. широко используют пента-фтор-, пентахлор-, трихлор- и n-нитрофениловые и ряд др. эфиров защищенных аминокислот и пептидов.

Карбодиимидный метод образования пептидной связи предусматривает использование в качестве конденсирующих реагентов разл. замещенных карбодиимидов. Особенно широкое применение при синтезе П. получил дициклогексил-карбодиимид:

пептиды. Рис. 2

пептиды. Рис. 3

X и Y — соотв. N- и С-защитные группы С этим конденсирующим реагентом можно осуществлять синтез П. и в водных средах, т. к. скорости реакций гидролиза и аминолиза промежуточно образующейся О-ацилизомо-чевины (II) существенно различаются. При синтезе П. находят также применение разл. водорастворимые карбодиими-ды (напр., N-диметиламинопропил-N'-этилкарбодиимид).

Метод смешанных ангидридов основан на предварит. активации карбоксильной компоненты пептидного синтеза путем образования смешанного ангидрида с карбоновой или неорг. кислотой. Наиб. часто используют алкиловые эфиры хлормуравьиной (хлоругольной) кислоты, особенно этиловый и изобутиловый эфиры, напр.:

пептиды. Рис. 4

В — третичный амин

При синтезе П. по этому методу весьма эффективны смешанные ангидриды N-ациламинокислот и пивалиновой (триметилуксусной) кислоты. Благодаря сильному положит. индуктивному эффекту трет-бутильной группы электро-фильность карбоксильного атома С в остатке пивалиновой кислоты существенно снижена, и это, наряду со стерич. препятствиями, подавляет нежелат. побочную реакцию образования уретана и своб. N-ациламинокислоты, которая осуществляется по схеме:

пептиды. Рис. 5

В одном из вариантов метода смешанных ангидридов применяют в качестве конденсирующего агента 1-этоксикарбонил-2-этокси-1,2-дигидрохинолин. Это соед. легко образует с карбоксильной компонентой пептидного синтеза про-межут. смешанный ангидрид, быстро вступающий в реакцию конденсации, причем полностью исключается нежелат. побочная реакция.

Частный случай метода смешанных ангидридов — метод симметрич. ангидридов, в котором используют ангидриды аминокислот [XNHCH(R)C(O)]2O. Их применение исключает возможность диспропорционирования или неправильного аминолиза.

Азидный метод синтеза предусматривает активацию карбоксильной компоненты предварит. превращением ее в азид N-замещенной аминокислоты или пептида:

пептиды. Рис. 6

Ввиду нестойкости азидов их в своб. виде из раствора, как правило, не выделяют. Если вместо нитритов щелочных металлов для реакции с гидразидом использовать алкиловые эфиры азотистой кислоты (напр., трет-бутилнитрит), то азид-ную конденсацию можно проводить в орг. растворителе; образующуюся HN3 связывают третичными аминами. Нередко азидная конденсация осложняется нежелат. побочными реакциями (превращ. гидразида не в азид, а в амид; реакция гидразида с азидом, ведущая к образованию 1,2-диацил-гидразина; промежут. образование изоцианата, который в результате перегруппировки Курциуса может приводить к производному мочевины или соответствующему уретану и др.). Преимущества азидного метода-малая степень рацемизации, возможность применения серина и треонина без защиты гидроксильных групп.

Для превращ. защищенных П. в свободные используют спец. методы деблокирования, которые основаны на реакциях, обеспечивающих отщепление разл. защитных групп, гарантирующих сохранение всех пептидных связей в молекуле. Примеры деблокирования: удаление бензил оксикарбониль-ной группы каталитич. гидрогенолизом при атм. давлении и комнатной температуре, отщепление трет-бутилоксикарбонильной группы мягким ацидолизом, а также гидролитич. отщепление трифторацетильной группы под действием разб. растворов оснований.

При синтезе биологически активных П. важно, чтобы не происходила рацемизация, которая может осуществляться в результате обратимого отщепления H+ от α-атома С N-ациламинокислоты или пептида. Рацемизации способствуют основания и кислоты, высокая температура и полярные растворители. Решающую роль играет рацемизация, катализируемая основаниями, которая может протекать по т. наз. азлактоновому механизму или через енолизацию по схеме:

пептиды. Рис. 7

Наиб. важные способы исключения рацемизации: 1) наращивание пептидной цепи в направлении от С-конца к N-концу с применением N-защитных групп типа ROC(O). 2) Активация N-защищенных пептидных фрагментов с С-концевыми остатками пролина или глицина. 3) Использование азид-ного метода (при отсутствии избытка третичного основания и поддержании низких температур в реакционной среде). 4) Применение активир. эфиров аминокислот, аминолиз которых протекает через переходное состояние, стабилизир. водородными мостиками (напр., эфиров, образованных с N-гидроксипипери-дином и 8-гидроксихинолином). 5) Использование карбоди-имидного метода с добавками N-гидроксисоед. или кислот Льюиса.

Наряду с синтезом П. в растворах, важное значение имеет синтез П. с применением нерастворимых носителей. Он включает твердофазный синтез П. (реакция, или метод, Мэр-рифилда) и синтез П. с использованием полимерных реагентов.

Стратегия твердофазного пептидного синтеза предусматривает временное закрепление синтезируемой пептидной цепи на нерастворимом полимерном носителе и осуществляется по схеме:

пептиды. Рис. 8

пептиды. Рис. 9

Благодаря этому способу удалось заменить весьма сложные и трудоемкие процедуры разделения и очистки промежут. пептидов простыми операциями промывки и фильтрования, а также свести процесс пептидного синтеза к стандартной последовательности периодически повторяющихся процедур, легко поддающихся автоматизации. Метод Меррифилда позволил существенно ускорить процесс синтеза П. На основе этой методологии созданы разл. типы автоматич. синтезаторов П.

Соединение высокопроизводит. твердофазного синтеза П. с разделяющими способностями препаративной ВЭЖХ обеспечивает выход на качественно новый уровень хим. синтеза П., что, в свою очередь, благотворно влияет на развитие разл. областей биохимии, мол. биологии, генной инженерии, биотехнологии, фармакологии и медицины.

Стратегия синтеза П. с применением полимерных реагентов предусматривает временное связывание с высокомол. носителем активир. карбоксильной компоненты или конденсирующего агента пептидного синтеза. Преимущество этого метода: закрепленные на полимере реагенты могут вводиться в избытке, а отделение синтезированных П. от нерастворимых полимеров не представляет затруднений.

Пример такого синтеза-пропускание аминокомпоненты в заданной последовательности через неск. колонок, в каждой из которых находится связанный с полимерным носителем активир. эфир определенной аминокислоты.

Наряду с линейными м. б. синтезированы циклические П. При синтезе гомодетных циклических П. используют те же методы образования пептидных связей, что и при синтезе линейных П. Для подавления побочной реакции линейной межмол. конденсации циклизацию ведут при высоком разбавлении.

Для синтеза гетеродетных циклических П. применяют реакции, обеспечивающие замыкание циклов путем образования новых дисульфидных или эфирных связей.

Частный случай синтеза П. — получение полиаминокислот и регулярных полипептидов, которое осуществляют поликонденсацией аминокислот или коротких П. Если в поликонденсацию вовлекаются функц. группы боковых цепей аминокислот, образуются разветвленные П. Для синтеза регулярных полипептидов наиб. часто применяют в качестве исходных соед. активир. эфиры коротких П. с незащищенной аминогруппой N-концевого аминокислотного остатка.

Все большее значение приобретают методы контролируемого ферментативного синтеза П. Они основаны на способности протеолитич. ферментов в определенных условиях (подбор растворителя, pH и др.) катализировать синтез пептидной связи с большей скоростью, чем ее гидролиз (осн. функция этих ферментов).

Перспективно также осуществление синтеза П. на ДНК-матрице с использованием рибосом, находящихся вне живой клетки, а также методами генетической инженерии.

Биологически активные П. Большую группу таких П. составляют пептидные гормоны (в т. ч. нейропептиды)-адрепокортикотропин, вазопрессин, гастрин, меланоцитсти-мулирующий гормон, окситоцин, опиоидные пептиды и др.

Некоторые П. — регуляторы иммунитета. К таким П. относят гормоны тимуса, тетрапептид тафтсин Thr—Lys—Pro—Arg (букв. обозначения см. в ст. аминокислоты), являющийся фрагментом домена CН2 иммуноглобулина G, и пептидный антибиотик циклоспорин А, обладающий иммунодепрессив-ными свойствами. К пептидным антибиотикам относят также актиномицины и др. Важную роль в активном транспорте ионов через биол. мембраны играют ионофоры.

Среди П. известны вещества, обладающие высокой токсичностью,-токсины из яда пчел и ос, П. из бледной поганки (фаллоидин, аманитины и др.), нейротоксины из яда змей (см. токсины). К биологически активным П. принадлежат анзерин, глутатион и карнозин, участвующие в биохим. реакциях в тканях животных, а также пептидные алкалоиды.

Некоторые П. обладают выраженными вкусовыми качествами, напр. аспартам слаще сахара в 200 раз.

Лит.: Гринштейн Дж., Виниц M., Химия аминокислот и пептидов, пер. с англ., М., 1965; Шредер Э., Любке К., Пептиды, пер. с англ., т. 1 2, М., 1967; Новые методы анализа аминокислот, пептидов и белков, пер. с англ., М., 1974; Дэвени Т., Гергей Я., Аминокислоты, пептиды и белки, пер. с англ., М., 1976; Пептиды, пер. с англ., М., 1983; Стюарт Дж., в кн.: Реакции на полимерных подложках в органическом синтезе, пер. с англ., М., 1983, с. 417 97; Ленинджер А., Основы биохимии, пер. с англ., т. 1 3, М., 1985; Якуб-ке X.-Д., Ешкайт X., Аминокислоты, пептиды, белки, пер. с нем., М., 1985.

Ю. П. Швачкин

Источник: Химическая энциклопедия на Gufo.me


Значения в других словарях

  1. пептиды — ПЕПТИДЫ — вещества, в состав которых входят две или более аминокислот, соединенных пептидными связями. В зависимости от количества входящих в П. остатков аминокислот различают дипептиды, трипептиды, тетрапептиды и т. Ботаника. Словарь терминов
  2. Пептиды — (от греч. peptós — сваренный, переваренный) органические вещества, состоящие из остатков одинаковых или различных аминокислот, соединённых пептидной связью (См. Пептидная связь). По числу аминокислотных остатков различают ди-, три-, тетрапептиды и т.д. Большая советская энциклопедия
  3. пептиды — ПЕПТИДЫ -ов; мн. [от греч. peptos — сваренный, переваренный]. Класс органических соединений, состоящих из аминокислот, образующихся естественным или искусственным путём и входящих в состав антибиотиков, гормонов, витаминов. ◁ Пептидный, -ая, -ое. П-ые соединения. Толковый словарь Кузнецова
  4. ПЕПТИДЫ — ПЕПТИДЫ — органическое вещества, состоящие из остатков аминокислот, соединенных пептидной связью. Различают ди-, три- и т. д. пептиды, а также полипептиды. В живых клетках пептиды синтезируются из аминокислот либо являются продуктами обмена белков. Большой энциклопедический словарь
  5. пептиды — орф. пептиды, -ов, ед. -тид, -а Орфографический словарь Лопатина
  6. пептиды — Органические вещества, молекулы которых построены из аминокислот, соединённых пептидной связью. В зависимости от числа входящих в молекулу аминокислот различают дипептиды, трипептиды и т.д., а также полипептиды. Биология. Современная энциклопедия
  7. Пептиды — Структурные элементы молекул белков, представляющие собой два или более остатков аминокислот, соединенных амидными связями; к П. и их производным относятся многие гормоны, антибиотики, некоторые витамины. Медицинская энциклопедия
  8. пептиды — Органич. вещества, состоящие из остатков одинаковых или разл. аминокислот, соединённых пептидной связью. По числу аминокислотных остатков различают ди-, три-, тетрапептиды и т. д., а также полипептиды. Молекула... Биологический энциклопедический словарь