подрубить под корень

кого. Разг. Экспрес. Причинить кому-либо непоправимый вред, урон. — Мы подрубили их [хунхузов] под корень. Они жили за счёт дани: корейцы и туземцы платили. Теперь мы вооружили тех и других (Фадеев. Последний из Удэге).

Источник: Фразеологический словарь русского литературного языка на Gufo.me