НИЛИН
Нила — производная форма имен Нил, Саторнил и других, еще менее известных. (Ф). Но тогда было бы более вероятна фамилия Нилов. А уменьшительная форма Нила может быть о женского имен Неонила — молодая, новая (греч.). (Э). Фамилия Нилус. Такая фамилия в имеющихся у меня источниках не рассматривается. Могу предложить следующее объяснение. Суффикс -ус используется в украинских фамилиях образованных от имен (Петр — Петрусь, Клим — Климус). Об этом можно прочитать в книге Унбегауна «Русские фамилии». Фамилия Нилус могла быть образована таким же способом от имени Нил.
Словарь русских фамилий