Этимологический словарь Макса Фасмера

пупень

пу́пень

"деревянная затычка для заделывания пробоин в лодке", олонецк. (Этногр. Обозр. 40, 350). Возм., из *пѫпьнь от пуп.

Этимологический словарь русского языка Макса Фасмера